自有厂房需要交纳的税种及计算方法如下：
营业税
建筑业营业税：按建筑业税目依3%的税率缴纳营业税。
不动产营业税：依5%的税率缴纳销售不动产营业税。
城市维护建设税和教育费附加：根据实际缴纳的增值税计算，城市维护建设税的税率分为三档（市区7%，县城、镇5%，其他地区1%），教育费附加的税率为3%。
土地增值税
应就转让厂房的收入减去有关扣除项目后的增值额，依超率累进税率计算缴纳土地增值税。
房产税
自用房产：按房产原值一次减除一定比例（通常为10%~30%）后的余值，税率为1.2%。
出租房产：按租金收入的12%计算缴纳房产税。
土地使用税
以纳税人实际占用的土地面积为计税依据，由土地所在地的税务机关征收，按照一定税率（大城市1.5元至30元/平方米，中等城市1.2元至24元/平方米，小城市0.9元至18元/平方米，县城、建制镇、工矿区0.6元至12元/平方米）按年缴纳。
印花税
办理合同、发票等法律文件时需要缴纳，按财产租赁合同租赁金额的千分之一贴花。
个人所得税
出租厂房的个人所得税按财产租赁所得计算，每次收入不超过4000元的，减除费用800元，4000元以上的，减除20%的费用，其余额为应纳税所得额，税率为20%。
增值税
出租厂房需要缴纳增值税，一般纳税人适用税率为11%，小规模纳税人按5%征收率计算缴纳。
综合计算示例
以1000万元的厂房为例，具体税额计算如下：
营业税
建筑业营业税：1000万 × 3% = 30万元
不动产营业税：1000万 × 5% = 50万元
城市维护建设税和教育费附加：90万元 × （7% + 3%） = 9万元
土地增值税
增值额：1000万 - 扣除项目金额（具体金额需根据当地政策确定）
税率：根据增值额占扣除项目金额的比例，分为30%、40%、50%、60%四档
房产税
自用房产税：1000万 × （1 - 扣除比例） × 1.2%
出租房产税：1000万 × 12%
土地使用税
根据实际占用的土地面积和当地规定的税额标准计算
印花税
租赁合同金额 × 0.01%
个人所得税
租金收入 × 20%
建议
企业和个人在自有厂房出租或转让时，应详细咨询当地税务机关，了解具体的税率和扣除标准，以确保合法合规纳税。同时，合理规划税务筹划，可以有效降低税负。
