办理农村合作社的流程如下：
成员确定与会议
至少需要5名具备民事行为的成员，其中农民户籍成员所占比例不低于80%。
召开设立合作社会议，选举理事会、监事会、理事长和监事长。
选定确立合作社名称（多选几个，以备工商注册时重名）、住所、注册资本（只需议定金额，不需要实缴）、营业范围。
材料准备
登记申请书、全体成员签字盖章的章程、法定代表人的身份证明、全体出资人员的签字盖章出资清单、住所使用证明、合作社名称预先申请书。
其他可能需要的文件包括：成员名册、成员身份证明复印件、指定代表或委托代理人的证明、业务范围涉及前置许可的文件等。
注册与登记
到所在地区县工商行政管理部门注册登记，递交合作社名称预先申请书及相关材料，等待乡镇出示合作社证明材料。
到工商局递交相关材料，领取《准予设立通知书》。
刻章与证件办理
到公安局定制刻章，提交合作社法人营业执照复印件、法人代表身份证复印件、经办人身份证复印件等，费用约400元。
质量技术监督局办理组织机构代码证，提交合作社法人营业执照副本原件及复印件等，费用约108元。
税务局申领税务登记证，提交法人营业执照副本及复印件、组织机构统一代码证书副本及复印件等，免收税务登记工本费。
银行开户与税务登记
到银行办理开户和账号，提交法人营业执照正副本及其复印件等材料。
将基本户对公账户报到税务局。
后续事项
按照国家有关规定，向登记机关报送年度报告，并向社会公示。
建议：
在办理过程中，建议多与政府相关部门沟通，取得政府的支持，以便顺利完成各项手续。
可以委托专业的会计师事务所代理注册，以节省时间和精力。
