夫妻公司在离婚时的分割方式主要依据《民法典》的相关规定，具体方法如下：
双方都愿意继续经营公司
夫妻双方都有经营能力且愿意继续共同经营的情况下，可以协商分割双方的股权比例。如果协商不成，可以通过法院调解或判决来确定股权比例。
双方都不愿意经营公司
如果夫妻双方均不愿意继续经营公司，可以选择解散公司并进行清算。在清算后，对公司剩余财产进行分割。
一方愿意继续经营，另一方愿意退出
夫妻一方要求保留并继续经营公司，而另一方要求退出公司并获得相应补偿的情况下，可以通过将部分股权转让给第三方的方法来解决。另外，也可以采用一方持绝对多数股权，另一方持有少数象征性股权的方式，以维持公司运营。
提交财产分割证明
在公司注册时，如果夫妻提交了“财产分割证明”，可以视为普通的有限责任公司。如果没有提交，夫妻股东名下的股权可能会被法院按照“共同共有财产对待”，此时公司有可能被视作“一人公司”处理。
法院判例
最高人民法院的判例指出，夫妻双方共同出资设立公司时，应以各自所有的财产作为注册资本，并各自承担相应的责任。未进行财产分割的，应认定为夫妻双方以共同共有财产出资设立公司，夫妻双方对该项财产享有平等的占有、使用、收益和处分的权利。
建议
提前规划：在设立夫妻公司时，建议提前进行财产分割，并明确各自的股权比例和责任，以避免后续纠纷。
